程序结构的组织事实上是确定所编入的子程序、中断程序的调用次序。在完成全部子程序、中断程序的输入与编辑后，可以在主程序中进行。
在主程序中，可以首先编辑子程序、中断程序的调用条件（触点的逻辑条件），并通过打开指令树中的指令文件夹(Instructions)打开指令分类文件夹Call Subroutines，再双击相应的子程序号，即可输入子程序、中断程序的调用功能框，以完成程序的组织过程(见图12-2.6)。